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Les dérivés du nitrobenzène suscitent un intérêt croissant en raison de leur toxicité élevée et de leurs effets néfastes sur l’environnement et la santé humaine. Dans ce contexte, le présent ouvrage propose une exploration approfondie des relations structure-toxicité de ces composés en s’appuyant sur une approche intégrée de chimie computationnelle. En combinant les méthodes pharmacophores 3D, 3D-QSPR, HQSPR, le Docking moléculaire, la dynamique moléculaire (MD) et la modélisation Monte Carlo, ce travail met en évidence les liens entre les caractéristiques structurales des dérivés du nitrobenzène et leur impact biologique. Une attention particulière a été portée à l’analyse des interactions moléculaires avec la protéine végétale PP2 (Phloem Protein 2), impliquée dans divers processus biologiques. Les modèles pharmacophores ont permis d’identifier les régions clés impliquées dans la reconnaissance ligand-récepteur, en révélant les contributions stériques, électrostatiques, hydrophobes, ainsi que les zones favorables aux donneurs et accepteurs de liaisons hydrogène. Ces données ont été croisées avec les modèles HQSPR (fondés sur des descripteurs atomiques), 3D-QSPR (analysant les champs moléculaires), et Monte Carlo (corrélant la structure SMILES à l’activité toxique), afin de construire des modèles prédictifs fiables. Sur la base de ces résultats, sept nouvelles structures (X1 à X7) ont été conçues, dont X1 et X2 ont démontré une affinité accrue et une stabilité remarquable avec la protéine cible, comme en témoignent les simulations de dynamique moléculaire sur 200 ns. L’ensemble des approches intégrées fournit des éléments fondamentaux pour la compréhension des mécanismes de toxicité des dérivés du nitrobenzène, tout en ouvrant des perspectives concrètes pour la conception de composés moins toxiques et mieux adaptés à des applications environnementales et pharmacologiques.